Protein–RNA interactions for Protein: Q11136

Pepd, Xaa-Pro dipeptidase, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PepdQ11136 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PepdQ11136 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PepdQ11136 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PepdQ11136 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PepdQ11136 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PepdQ11136 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PepdQ11136 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PepdQ11136 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PepdQ11136 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PepdQ11136 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PepdQ11136 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PepdQ11136 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PepdQ11136 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PepdQ11136 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PepdQ11136 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PepdQ11136 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PepdQ11136 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PepdQ11136 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PepdQ11136 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PepdQ11136 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PepdQ11136 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PepdQ11136 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PepdQ11136 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PepdQ11136 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PepdQ11136 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PepdQ11136 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PepdQ11136 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PepdQ11136 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PepdQ11136 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PepdQ11136 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PepdQ11136 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PepdQ11136 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PepdQ11136 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PepdQ11136 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PepdQ11136 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PepdQ11136 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PepdQ11136 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PepdQ11136 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PepdQ11136 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PepdQ11136 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PepdQ11136 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PepdQ11136 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PepdQ11136 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PepdQ11136 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PepdQ11136 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PepdQ11136 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PepdQ11136 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PepdQ11136 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PepdQ11136 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PepdQ11136 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PepdQ11136 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PepdQ11136 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PepdQ11136 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PepdQ11136 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PepdQ11136 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PepdQ11136 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PepdQ11136 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PepdQ11136 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PepdQ11136 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PepdQ11136 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PepdQ11136 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PepdQ11136 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PepdQ11136 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PepdQ11136 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PepdQ11136 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PepdQ11136 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PepdQ11136 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PepdQ11136 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PepdQ11136 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PepdQ11136 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PepdQ11136 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PepdQ11136 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PepdQ11136 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PepdQ11136 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PepdQ11136 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PepdQ11136 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PepdQ11136 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PepdQ11136 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PepdQ11136 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PepdQ11136 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PepdQ11136 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PepdQ11136 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PepdQ11136 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PepdQ11136 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PepdQ11136 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PepdQ11136 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PepdQ11136 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PepdQ11136 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PepdQ11136 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PepdQ11136 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PepdQ11136 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PepdQ11136 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PepdQ11136 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PepdQ11136 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PepdQ11136 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PepdQ11136 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PepdQ11136 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PepdQ11136 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PepdQ11136 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PepdQ11136 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms