Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Shisal1Q0VBP7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Shisal1Q0VBP7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shisal1Q0VBP7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shisal1Q0VBP7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shisal1Q0VBP7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Shisal1Q0VBP7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisal1Q0VBP7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisal1Q0VBP7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisal1Q0VBP7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisal1Q0VBP7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisal1Q0VBP7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisal1Q0VBP7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Shisal1Q0VBP7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shisal1Q0VBP7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Shisal1Q0VBP7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shisal1Q0VBP7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shisal1Q0VBP7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shisal1Q0VBP7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shisal1Q0VBP7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shisal1Q0VBP7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Shisal1Q0VBP7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisal1Q0VBP7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisal1Q0VBP7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisal1Q0VBP7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisal1Q0VBP7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisal1Q0VBP7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Shisal1Q0VBP7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisal1Q0VBP7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisal1Q0VBP7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisal1Q0VBP7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisal1Q0VBP7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Shisal1Q0VBP7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisal1Q0VBP7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisal1Q0VBP7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Shisal1Q0VBP7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shisal1Q0VBP7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Shisal1Q0VBP7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisal1Q0VBP7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisal1Q0VBP7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisal1Q0VBP7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisal1Q0VBP7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisal1Q0VBP7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Shisal1Q0VBP7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisal1Q0VBP7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisal1Q0VBP7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisal1Q0VBP7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisal1Q0VBP7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisal1Q0VBP7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Shisal1Q0VBP7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shisal1Q0VBP7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shisal1Q0VBP7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shisal1Q0VBP7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shisal1Q0VBP7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shisal1Q0VBP7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shisal1Q0VBP7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shisal1Q0VBP7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shisal1Q0VBP7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shisal1Q0VBP7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shisal1Q0VBP7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisal1Q0VBP7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisal1Q0VBP7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisal1Q0VBP7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisal1Q0VBP7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shisal1Q0VBP7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shisal1Q0VBP7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms