Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Znf541Q0GGX2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Znf541Q0GGX2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Znf541Q0GGX2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Znf541Q0GGX2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Znf541Q0GGX2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Znf541Q0GGX2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Znf541Q0GGX2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Znf541Q0GGX2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Znf541Q0GGX2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Znf541Q0GGX2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Znf541Q0GGX2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Znf541Q0GGX2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Znf541Q0GGX2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Znf541Q0GGX2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Znf541Q0GGX2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Znf541Q0GGX2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Znf541Q0GGX2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Znf541Q0GGX2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Znf541Q0GGX2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Znf541Q0GGX2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Znf541Q0GGX2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Znf541Q0GGX2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Znf541Q0GGX2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Znf541Q0GGX2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Znf541Q0GGX2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Znf541Q0GGX2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Znf541Q0GGX2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Znf541Q0GGX2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Znf541Q0GGX2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Znf541Q0GGX2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Znf541Q0GGX2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Znf541Q0GGX2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Znf541Q0GGX2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Znf541Q0GGX2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Znf541Q0GGX2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Znf541Q0GGX2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Znf541Q0GGX2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Znf541Q0GGX2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Znf541Q0GGX2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Znf541Q0GGX2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Znf541Q0GGX2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
Znf541Q0GGX2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Znf541Q0GGX2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Znf541Q0GGX2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Znf541Q0GGX2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Znf541Q0GGX2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Znf541Q0GGX2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Znf541Q0GGX2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Znf541Q0GGX2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Znf541Q0GGX2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Znf541Q0GGX2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Znf541Q0GGX2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Znf541Q0GGX2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Znf541Q0GGX2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Znf541Q0GGX2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Znf541Q0GGX2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Znf541Q0GGX2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Znf541Q0GGX2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Znf541Q0GGX2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Znf541Q0GGX2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Znf541Q0GGX2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Znf541Q0GGX2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Znf541Q0GGX2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Znf541Q0GGX2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Znf541Q0GGX2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Znf541Q0GGX2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Znf541Q0GGX2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Znf541Q0GGX2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Znf541Q0GGX2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Znf541Q0GGX2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Znf541Q0GGX2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Znf541Q0GGX2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Znf541Q0GGX2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Znf541Q0GGX2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Znf541Q0GGX2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Znf541Q0GGX2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Znf541Q0GGX2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Znf541Q0GGX2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Znf541Q0GGX2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Znf541Q0GGX2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Znf541Q0GGX2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Znf541Q0GGX2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Znf541Q0GGX2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Znf541Q0GGX2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Znf541Q0GGX2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Znf541Q0GGX2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Znf541Q0GGX2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Znf541Q0GGX2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Znf541Q0GGX2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Znf541Q0GGX2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Znf541Q0GGX2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Znf541Q0GGX2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Znf541Q0GGX2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Znf541Q0GGX2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Znf541Q0GGX2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Znf541Q0GGX2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Znf541Q0GGX2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Znf541Q0GGX2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Znf541Q0GGX2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms