Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cdx4Q07424 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cdx4Q07424 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdx4Q07424 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.5 ms