Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrx2Q06348 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prrx2Q06348 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prrx2Q06348 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prrx2Q06348 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prrx2Q06348 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prrx2Q06348 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prrx2Q06348 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prrx2Q06348 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prrx2Q06348 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Prrx2Q06348 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prrx2Q06348 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prrx2Q06348 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prrx2Q06348 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prrx2Q06348 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prrx2Q06348 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prrx2Q06348 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prrx2Q06348 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prrx2Q06348 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prrx2Q06348 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Prrx2Q06348 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Prrx2Q06348 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prrx2Q06348 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prrx2Q06348 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prrx2Q06348 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prrx2Q06348 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prrx2Q06348 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prrx2Q06348 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prrx2Q06348 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prrx2Q06348 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Prrx2Q06348 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prrx2Q06348 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prrx2Q06348 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prrx2Q06348 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prrx2Q06348 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prrx2Q06348 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prrx2Q06348 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prrx2Q06348 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prrx2Q06348 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prrx2Q06348 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prrx2Q06348 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prrx2Q06348 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prrx2Q06348 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prrx2Q06348 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prrx2Q06348 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prrx2Q06348 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prrx2Q06348 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prrx2Q06348 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Prrx2Q06348 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prrx2Q06348 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prrx2Q06348 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prrx2Q06348 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prrx2Q06348 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prrx2Q06348 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prrx2Q06348 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prrx2Q06348 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prrx2Q06348 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prrx2Q06348 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prrx2Q06348 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prrx2Q06348 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prrx2Q06348 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prrx2Q06348 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prrx2Q06348 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prrx2Q06348 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prrx2Q06348 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrx2Q06348 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrx2Q06348 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrx2Q06348 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrx2Q06348 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrx2Q06348 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prrx2Q06348 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrx2Q06348 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrx2Q06348 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrx2Q06348 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrx2Q06348 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrx2Q06348 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prrx2Q06348 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms