Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPINDOCQ05AH6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPINDOCQ05AH6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPINDOCQ05AH6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPINDOCQ05AH6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPINDOCQ05AH6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPINDOCQ05AH6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPINDOCQ05AH6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPINDOCQ05AH6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPINDOCQ05AH6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPINDOCQ05AH6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SPINDOCQ05AH6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPINDOCQ05AH6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPINDOCQ05AH6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPINDOCQ05AH6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPINDOCQ05AH6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPINDOCQ05AH6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPINDOCQ05AH6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPINDOCQ05AH6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPINDOCQ05AH6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SPINDOCQ05AH6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPINDOCQ05AH6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPINDOCQ05AH6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPINDOCQ05AH6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPINDOCQ05AH6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPINDOCQ05AH6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPINDOCQ05AH6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPINDOCQ05AH6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPINDOCQ05AH6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPINDOCQ05AH6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPINDOCQ05AH6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SPINDOCQ05AH6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPINDOCQ05AH6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPINDOCQ05AH6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPINDOCQ05AH6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SPINDOCQ05AH6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPINDOCQ05AH6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPINDOCQ05AH6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SPINDOCQ05AH6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPINDOCQ05AH6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPINDOCQ05AH6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPINDOCQ05AH6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPINDOCQ05AH6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPINDOCQ05AH6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPINDOCQ05AH6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPINDOCQ05AH6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPINDOCQ05AH6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPINDOCQ05AH6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPINDOCQ05AH6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPINDOCQ05AH6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPINDOCQ05AH6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPINDOCQ05AH6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPINDOCQ05AH6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPINDOCQ05AH6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SPINDOCQ05AH6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPINDOCQ05AH6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPINDOCQ05AH6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPINDOCQ05AH6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPINDOCQ05AH6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPINDOCQ05AH6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPINDOCQ05AH6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPINDOCQ05AH6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPINDOCQ05AH6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPINDOCQ05AH6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPINDOCQ05AH6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPINDOCQ05AH6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPINDOCQ05AH6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPINDOCQ05AH6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPINDOCQ05AH6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPINDOCQ05AH6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPINDOCQ05AH6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPINDOCQ05AH6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPINDOCQ05AH6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPINDOCQ05AH6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPINDOCQ05AH6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SPINDOCQ05AH6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SPINDOCQ05AH6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPINDOCQ05AH6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPINDOCQ05AH6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPINDOCQ05AH6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPINDOCQ05AH6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPINDOCQ05AH6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPINDOCQ05AH6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPINDOCQ05AH6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPINDOCQ05AH6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPINDOCQ05AH6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPINDOCQ05AH6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPINDOCQ05AH6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPINDOCQ05AH6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPINDOCQ05AH6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPINDOCQ05AH6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPINDOCQ05AH6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPINDOCQ05AH6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPINDOCQ05AH6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPINDOCQ05AH6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms