Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scg2Q03517 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scg2Q03517 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scg2Q03517 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scg2Q03517 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scg2Q03517 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scg2Q03517 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scg2Q03517 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scg2Q03517 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scg2Q03517 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scg2Q03517 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scg2Q03517 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scg2Q03517 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scg2Q03517 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scg2Q03517 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scg2Q03517 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scg2Q03517 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scg2Q03517 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scg2Q03517 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scg2Q03517 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scg2Q03517 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Scg2Q03517 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scg2Q03517 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scg2Q03517 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scg2Q03517 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scg2Q03517 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scg2Q03517 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scg2Q03517 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scg2Q03517 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scg2Q03517 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scg2Q03517 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Scg2Q03517 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scg2Q03517 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scg2Q03517 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scg2Q03517 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scg2Q03517 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scg2Q03517 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scg2Q03517 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scg2Q03517 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scg2Q03517 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scg2Q03517 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scg2Q03517 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scg2Q03517 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scg2Q03517 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scg2Q03517 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scg2Q03517 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scg2Q03517 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scg2Q03517 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scg2Q03517 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scg2Q03517 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scg2Q03517 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scg2Q03517 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scg2Q03517 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scg2Q03517 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scg2Q03517 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scg2Q03517 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Scg2Q03517 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Scg2Q03517 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Scg2Q03517 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Scg2Q03517 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scg2Q03517 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scg2Q03517 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Scg2Q03517 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scg2Q03517 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scg2Q03517 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scg2Q03517 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scg2Q03517 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scg2Q03517 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scg2Q03517 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scg2Q03517 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Scg2Q03517 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scg2Q03517 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scg2Q03517 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scg2Q03517 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scg2Q03517 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Scg2Q03517 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Scg2Q03517 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scg2Q03517 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scg2Q03517 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Scg2Q03517 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scg2Q03517 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scg2Q03517 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scg2Q03517 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scg2Q03517 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scg2Q03517 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scg2Q03517 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scg2Q03517 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Scg2Q03517 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scg2Q03517 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scg2Q03517 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scg2Q03517 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scg2Q03517 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scg2Q03517 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scg2Q03517 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Scg2Q03517 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Scg2Q03517 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Scg2Q03517 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scg2Q03517 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scg2Q03517 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scg2Q03517 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms