Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HmgcrQ01237 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HmgcrQ01237 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HmgcrQ01237 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HmgcrQ01237 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HmgcrQ01237 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HmgcrQ01237 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HmgcrQ01237 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HmgcrQ01237 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HmgcrQ01237 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HmgcrQ01237 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HmgcrQ01237 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HmgcrQ01237 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HmgcrQ01237 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HmgcrQ01237 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HmgcrQ01237 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HmgcrQ01237 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HmgcrQ01237 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HmgcrQ01237 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HmgcrQ01237 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HmgcrQ01237 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HmgcrQ01237 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HmgcrQ01237 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HmgcrQ01237 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HmgcrQ01237 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HmgcrQ01237 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HmgcrQ01237 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HmgcrQ01237 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HmgcrQ01237 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HmgcrQ01237 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HmgcrQ01237 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HmgcrQ01237 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HmgcrQ01237 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HmgcrQ01237 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HmgcrQ01237 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HmgcrQ01237 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HmgcrQ01237 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HmgcrQ01237 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HmgcrQ01237 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HmgcrQ01237 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HmgcrQ01237 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HmgcrQ01237 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HmgcrQ01237 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HmgcrQ01237 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HmgcrQ01237 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HmgcrQ01237 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HmgcrQ01237 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HmgcrQ01237 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HmgcrQ01237 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HmgcrQ01237 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HmgcrQ01237 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HmgcrQ01237 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HmgcrQ01237 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HmgcrQ01237 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HmgcrQ01237 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HmgcrQ01237 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HmgcrQ01237 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HmgcrQ01237 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HmgcrQ01237 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HmgcrQ01237 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HmgcrQ01237 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HmgcrQ01237 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HmgcrQ01237 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HmgcrQ01237 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HmgcrQ01237 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HmgcrQ01237 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HmgcrQ01237 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HmgcrQ01237 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HmgcrQ01237 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HmgcrQ01237 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HmgcrQ01237 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HmgcrQ01237 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HmgcrQ01237 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HmgcrQ01237 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HmgcrQ01237 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HmgcrQ01237 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HmgcrQ01237 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HmgcrQ01237 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HmgcrQ01237 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HmgcrQ01237 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HmgcrQ01237 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HmgcrQ01237 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HmgcrQ01237 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HmgcrQ01237 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HmgcrQ01237 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HmgcrQ01237 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HmgcrQ01237 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HmgcrQ01237 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HmgcrQ01237 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HmgcrQ01237 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HmgcrQ01237 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HmgcrQ01237 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HmgcrQ01237 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HmgcrQ01237 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HmgcrQ01237 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HmgcrQ01237 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HmgcrQ01237 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HmgcrQ01237 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HmgcrQ01237 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HmgcrQ01237 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms