Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga4Q00651 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga4Q00651 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga4Q00651 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga4Q00651 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga4Q00651 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga4Q00651 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga4Q00651 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga4Q00651 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga4Q00651 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga4Q00651 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga4Q00651 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga4Q00651 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga4Q00651 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga4Q00651 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga4Q00651 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga4Q00651 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga4Q00651 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga4Q00651 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga4Q00651 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga4Q00651 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itga4Q00651 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itga4Q00651 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Itga4Q00651 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga4Q00651 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Itga4Q00651 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga4Q00651 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga4Q00651 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga4Q00651 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga4Q00651 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Itga4Q00651 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga4Q00651 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga4Q00651 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Itga4Q00651 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga4Q00651 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga4Q00651 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga4Q00651 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga4Q00651 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga4Q00651 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itga4Q00651 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itga4Q00651 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga4Q00651 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga4Q00651 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga4Q00651 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Itga4Q00651 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Itga4Q00651 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga4Q00651 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga4Q00651 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga4Q00651 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga4Q00651 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga4Q00651 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga4Q00651 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga4Q00651 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga4Q00651 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga4Q00651 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga4Q00651 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga4Q00651 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga4Q00651 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga4Q00651 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga4Q00651 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga4Q00651 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga4Q00651 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga4Q00651 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga4Q00651 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga4Q00651 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga4Q00651 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga4Q00651 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga4Q00651 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga4Q00651 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga4Q00651 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga4Q00651 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga4Q00651 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Itga4Q00651 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga4Q00651 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga4Q00651 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Itga4Q00651 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga4Q00651 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga4Q00651 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga4Q00651 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga4Q00651 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga4Q00651 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Itga4Q00651 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Itga4Q00651 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Itga4Q00651 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga4Q00651 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga4Q00651 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga4Q00651 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga4Q00651 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga4Q00651 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga4Q00651 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga4Q00651 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga4Q00651 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga4Q00651 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga4Q00651 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga4Q00651 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga4Q00651 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga4Q00651 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itga4Q00651 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itga4Q00651 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itga4Q00651 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms