Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
F8a1Q00558 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
F8a1Q00558 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
F8a1Q00558 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
F8a1Q00558 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
F8a1Q00558 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
F8a1Q00558 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
F8a1Q00558 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
F8a1Q00558 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
F8a1Q00558 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
F8a1Q00558 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
F8a1Q00558 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
F8a1Q00558 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
F8a1Q00558 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
F8a1Q00558 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
F8a1Q00558 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
F8a1Q00558 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
F8a1Q00558 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
F8a1Q00558 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
F8a1Q00558 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
F8a1Q00558 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
F8a1Q00558 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
F8a1Q00558 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
F8a1Q00558 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
F8a1Q00558 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
F8a1Q00558 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
F8a1Q00558 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
F8a1Q00558 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
F8a1Q00558 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
F8a1Q00558 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
F8a1Q00558 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
F8a1Q00558 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
F8a1Q00558 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
F8a1Q00558 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
F8a1Q00558 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
F8a1Q00558 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
F8a1Q00558 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
F8a1Q00558 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
F8a1Q00558 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
F8a1Q00558 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
F8a1Q00558 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
F8a1Q00558 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
F8a1Q00558 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
F8a1Q00558 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
F8a1Q00558 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
F8a1Q00558 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
F8a1Q00558 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
F8a1Q00558 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
F8a1Q00558 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
F8a1Q00558 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
F8a1Q00558 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
F8a1Q00558 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
F8a1Q00558 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
F8a1Q00558 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
F8a1Q00558 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
F8a1Q00558 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
F8a1Q00558 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
F8a1Q00558 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
F8a1Q00558 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
F8a1Q00558 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
F8a1Q00558 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
F8a1Q00558 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
F8a1Q00558 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
F8a1Q00558 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
F8a1Q00558 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
F8a1Q00558 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
F8a1Q00558 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
F8a1Q00558 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
F8a1Q00558 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
F8a1Q00558 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
F8a1Q00558 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
F8a1Q00558 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
F8a1Q00558 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
F8a1Q00558 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
F8a1Q00558 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
F8a1Q00558 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
F8a1Q00558 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
F8a1Q00558 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
F8a1Q00558 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
F8a1Q00558 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
F8a1Q00558 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
F8a1Q00558 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
F8a1Q00558 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
F8a1Q00558 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
F8a1Q00558 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
F8a1Q00558 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
F8a1Q00558 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
F8a1Q00558 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
F8a1Q00558 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
F8a1Q00558 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.9 ms