Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp10Q000W5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp10Q000W5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp10Q000W5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp10Q000W5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp10Q000W5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp10Q000W5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp10Q000W5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp10Q000W5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp10Q000W5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp10Q000W5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp10Q000W5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp10Q000W5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp10Q000W5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp10Q000W5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp10Q000W5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp10Q000W5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp10Q000W5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp10Q000W5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp10Q000W5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp10Q000W5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp10Q000W5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp10Q000W5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp10Q000W5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp10Q000W5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp10Q000W5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp10Q000W5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp10Q000W5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp10Q000W5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp10Q000W5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp10Q000W5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp10Q000W5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp10Q000W5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp10Q000W5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp10Q000W5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp10Q000W5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp10Q000W5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp10Q000W5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbp10Q000W5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbp10Q000W5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbp10Q000W5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbp10Q000W5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbp10Q000W5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbp10Q000W5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbp10Q000W5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbp10Q000W5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbp10Q000W5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbp10Q000W5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbp10Q000W5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbp10Q000W5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbp10Q000W5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbp10Q000W5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbp10Q000W5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbp10Q000W5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbp10Q000W5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbp10Q000W5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gbp10Q000W5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbp10Q000W5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbp10Q000W5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbp10Q000W5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms