Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VegfdP97946 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VegfdP97946 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VegfdP97946 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VegfdP97946 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VegfdP97946 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VegfdP97946 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VegfdP97946 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VegfdP97946 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VegfdP97946 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VegfdP97946 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VegfdP97946 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VegfdP97946 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VegfdP97946 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VegfdP97946 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VegfdP97946 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VegfdP97946 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VegfdP97946 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VegfdP97946 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VegfdP97946 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VegfdP97946 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VegfdP97946 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VegfdP97946 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VegfdP97946 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VegfdP97946 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VegfdP97946 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VegfdP97946 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VegfdP97946 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VegfdP97946 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VegfdP97946 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VegfdP97946 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VegfdP97946 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VegfdP97946 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VegfdP97946 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VegfdP97946 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VegfdP97946 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VegfdP97946 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VegfdP97946 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VegfdP97946 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VegfdP97946 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VegfdP97946 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VegfdP97946 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VegfdP97946 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VegfdP97946 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VegfdP97946 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VegfdP97946 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VegfdP97946 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VegfdP97946 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VegfdP97946 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VegfdP97946 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VegfdP97946 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VegfdP97946 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VegfdP97946 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VegfdP97946 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VegfdP97946 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VegfdP97946 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VegfdP97946 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VegfdP97946 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
VegfdP97946 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VegfdP97946 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VegfdP97946 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VegfdP97946 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VegfdP97946 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VegfdP97946 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VegfdP97946 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VegfdP97946 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VegfdP97946 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VegfdP97946 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VegfdP97946 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VegfdP97946 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VegfdP97946 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VegfdP97946 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VegfdP97946 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VegfdP97946 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VegfdP97946 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VegfdP97946 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VegfdP97946 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VegfdP97946 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VegfdP97946 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VegfdP97946 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VegfdP97946 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VegfdP97946 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VegfdP97946 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VegfdP97946 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VegfdP97946 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
VegfdP97946 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VegfdP97946 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VegfdP97946 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VegfdP97946 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VegfdP97946 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VegfdP97946 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VegfdP97946 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VegfdP97946 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VegfdP97946 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VegfdP97946 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VegfdP97946 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VegfdP97946 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VegfdP97946 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VegfdP97946 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VegfdP97946 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms