Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra1P97785 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra1P97785 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra1P97785 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra1P97785 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra1P97785 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gfra1P97785 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra1P97785 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra1P97785 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra1P97785 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra1P97785 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gfra1P97785 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfra1P97785 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfra1P97785 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gfra1P97785 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfra1P97785 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfra1P97785 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfra1P97785 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gfra1P97785 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Gfra1P97785 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gfra1P97785 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms