Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bop1P97452 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Bop1P97452 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bop1P97452 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bop1P97452 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bop1P97452 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bop1P97452 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bop1P97452 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bop1P97452 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bop1P97452 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bop1P97452 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bop1P97452 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bop1P97452 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bop1P97452 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bop1P97452 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bop1P97452 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bop1P97452 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bop1P97452 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bop1P97452 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bop1P97452 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bop1P97452 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bop1P97452 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bop1P97452 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bop1P97452 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bop1P97452 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bop1P97452 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bop1P97452 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bop1P97452 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bop1P97452 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bop1P97452 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bop1P97452 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bop1P97452 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bop1P97452 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bop1P97452 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bop1P97452 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bop1P97452 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bop1P97452 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bop1P97452 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bop1P97452 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bop1P97452 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bop1P97452 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bop1P97452 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bop1P97452 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bop1P97452 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bop1P97452 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bop1P97452 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bop1P97452 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bop1P97452 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bop1P97452 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bop1P97452 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bop1P97452 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bop1P97452 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bop1P97452 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bop1P97452 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bop1P97452 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bop1P97452 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Bop1P97452 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bop1P97452 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Bop1P97452 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bop1P97452 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bop1P97452 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bop1P97452 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bop1P97452 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bop1P97452 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bop1P97452 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bop1P97452 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bop1P97452 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bop1P97452 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bop1P97452 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bop1P97452 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Bop1P97452 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bop1P97452 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bop1P97452 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bop1P97452 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bop1P97452 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bop1P97452 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bop1P97452 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bop1P97452 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bop1P97452 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bop1P97452 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bop1P97452 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bop1P97452 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bop1P97452 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bop1P97452 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bop1P97452 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bop1P97452 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bop1P97452 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bop1P97452 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bop1P97452 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Bop1P97452 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bop1P97452 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bop1P97452 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Bop1P97452 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Bop1P97452 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bop1P97452 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bop1P97452 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bop1P97452 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bop1P97452 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bop1P97452 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bop1P97452 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms