Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Psme1P97371 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Psme1P97371 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Psme1P97371 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Psme1P97371 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Psme1P97371 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Psme1P97371 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Psme1P97371 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Psme1P97371 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Psme1P97371 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Psme1P97371 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Psme1P97371 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Psme1P97371 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Psme1P97371 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Psme1P97371 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Psme1P97371 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Psme1P97371 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Psme1P97371 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Psme1P97371 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Psme1P97371 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Psme1P97371 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Psme1P97371 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Psme1P97371 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Psme1P97371 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Psme1P97371 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Psme1P97371 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Psme1P97371 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Psme1P97371 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Psme1P97371 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Psme1P97371 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Psme1P97371 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Psme1P97371 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Psme1P97371 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Psme1P97371 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Psme1P97371 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Psme1P97371 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Psme1P97371 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Psme1P97371 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Psme1P97371 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Psme1P97371 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Psme1P97371 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Psme1P97371 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Psme1P97371 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Psme1P97371 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Psme1P97371 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Psme1P97371 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Psme1P97371 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Psme1P97371 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Psme1P97371 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Psme1P97371 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Psme1P97371 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Psme1P97371 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Psme1P97371 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Psme1P97371 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Psme1P97371 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Psme1P97371 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Psme1P97371 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Psme1P97371 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Psme1P97371 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Psme1P97371 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Psme1P97371 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Psme1P97371 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Psme1P97371 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Psme1P97371 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Psme1P97371 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Psme1P97371 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Psme1P97371 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Psme1P97371 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Psme1P97371 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Psme1P97371 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Psme1P97371 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Psme1P97371 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Psme1P97371 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Psme1P97371 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Psme1P97371 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Psme1P97371 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Psme1P97371 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Psme1P97371 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Psme1P97371 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Psme1P97371 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Psme1P97371 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Psme1P97371 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Psme1P97371 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Psme1P97371 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Psme1P97371 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Psme1P97371 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Psme1P97371 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Psme1P97371 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Psme1P97371 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Psme1P97371 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Psme1P97371 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Psme1P97371 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Psme1P97371 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Psme1P97371 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Psme1P97371 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Psme1P97371 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Psme1P97371 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Psme1P97371 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Psme1P97371 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Psme1P97371 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms