Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cbx1P83917 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cbx1P83917 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cbx1P83917 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cbx1P83917 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cbx1P83917 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cbx1P83917 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cbx1P83917 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cbx1P83917 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cbx1P83917 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cbx1P83917 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cbx1P83917 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cbx1P83917 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cbx1P83917 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cbx1P83917 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cbx1P83917 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cbx1P83917 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cbx1P83917 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cbx1P83917 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cbx1P83917 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cbx1P83917 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cbx1P83917 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cbx1P83917 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cbx1P83917 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cbx1P83917 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cbx1P83917 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cbx1P83917 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cbx1P83917 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cbx1P83917 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cbx1P83917 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cbx1P83917 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cbx1P83917 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cbx1P83917 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cbx1P83917 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cbx1P83917 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cbx1P83917 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cbx1P83917 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cbx1P83917 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cbx1P83917 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cbx1P83917 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cbx1P83917 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cbx1P83917 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cbx1P83917 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cbx1P83917 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cbx1P83917 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cbx1P83917 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cbx1P83917 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cbx1P83917 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cbx1P83917 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cbx1P83917 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cbx1P83917 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cbx1P83917 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cbx1P83917 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cbx1P83917 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cbx1P83917 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cbx1P83917 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cbx1P83917 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cbx1P83917 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cbx1P83917 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cbx1P83917 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cbx1P83917 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cbx1P83917 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cbx1P83917 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cbx1P83917 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cbx1P83917 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cbx1P83917 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cbx1P83917 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cbx1P83917 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cbx1P83917 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cbx1P83917 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cbx1P83917 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cbx1P83917 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cbx1P83917 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cbx1P83917 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cbx1P83917 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cbx1P83917 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cbx1P83917 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cbx1P83917 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cbx1P83917 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cbx1P83917 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cbx1P83917 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cbx1P83917 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cbx1P83917 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cbx1P83917 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cbx1P83917 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cbx1P83917 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cbx1P83917 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cbx1P83917 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cbx1P83917 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cbx1P83917 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cbx1P83917 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cbx1P83917 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cbx1P83917 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cbx1P83917 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cbx1P83917 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cbx1P83917 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cbx1P83917 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cbx1P83917 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cbx1P83917 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cbx1P83917 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms