Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otx1P80205 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otx1P80205 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otx1P80205 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Otx1P80205 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Otx1P80205 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otx1P80205 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otx1P80205 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otx1P80205 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otx1P80205 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otx1P80205 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Otx1P80205 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Otx1P80205 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Otx1P80205 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Otx1P80205 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Otx1P80205 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Otx1P80205 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Otx1P80205 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Otx1P80205 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Otx1P80205 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Otx1P80205 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Otx1P80205 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Otx1P80205 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Otx1P80205 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Otx1P80205 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Otx1P80205 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Otx1P80205 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Otx1P80205 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Otx1P80205 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Otx1P80205 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Otx1P80205 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Otx1P80205 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Otx1P80205 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Otx1P80205 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Otx1P80205 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Otx1P80205 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Otx1P80205 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Otx1P80205 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Otx1P80205 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Otx1P80205 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otx1P80205 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otx1P80205 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otx1P80205 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Otx1P80205 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otx1P80205 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otx1P80205 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otx1P80205 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otx1P80205 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otx1P80205 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otx1P80205 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otx1P80205 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otx1P80205 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Otx1P80205 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otx1P80205 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otx1P80205 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otx1P80205 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otx1P80205 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otx1P80205 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otx1P80205 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otx1P80205 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otx1P80205 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otx1P80205 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otx1P80205 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otx1P80205 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otx1P80205 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otx1P80205 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otx1P80205 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otx1P80205 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otx1P80205 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otx1P80205 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Otx1P80205 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otx1P80205 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Otx1P80205 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms