Protein–RNA interactions for Protein: P70414

Slc8a1, Sodium/calcium exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a1P70414 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc8a1P70414 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc8a1P70414 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc8a1P70414 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc8a1P70414 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc8a1P70414 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc8a1P70414 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc8a1P70414 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc8a1P70414 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc8a1P70414 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc8a1P70414 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc8a1P70414 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc8a1P70414 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc8a1P70414 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc8a1P70414 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc8a1P70414 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc8a1P70414 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc8a1P70414 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc8a1P70414 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc8a1P70414 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc8a1P70414 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc8a1P70414 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc8a1P70414 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc8a1P70414 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc8a1P70414 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc8a1P70414 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc8a1P70414 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc8a1P70414 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc8a1P70414 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc8a1P70414 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc8a1P70414 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc8a1P70414 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc8a1P70414 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc8a1P70414 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc8a1P70414 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc8a1P70414 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc8a1P70414 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc8a1P70414 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc8a1P70414 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc8a1P70414 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc8a1P70414 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc8a1P70414 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc8a1P70414 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc8a1P70414 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc8a1P70414 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc8a1P70414 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc8a1P70414 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc8a1P70414 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc8a1P70414 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc8a1P70414 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc8a1P70414 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc8a1P70414 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc8a1P70414 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc8a1P70414 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc8a1P70414 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc8a1P70414 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc8a1P70414 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc8a1P70414 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc8a1P70414 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc8a1P70414 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc8a1P70414 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc8a1P70414 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc8a1P70414 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc8a1P70414 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc8a1P70414 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc8a1P70414 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc8a1P70414 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc8a1P70414 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc8a1P70414 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc8a1P70414 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc8a1P70414 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc8a1P70414 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc8a1P70414 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc8a1P70414 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc8a1P70414 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc8a1P70414 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc8a1P70414 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc8a1P70414 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc8a1P70414 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc8a1P70414 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc8a1P70414 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc8a1P70414 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc8a1P70414 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc8a1P70414 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc8a1P70414 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc8a1P70414 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc8a1P70414 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc8a1P70414 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc8a1P70414 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc8a1P70414 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc8a1P70414 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc8a1P70414 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc8a1P70414 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc8a1P70414 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc8a1P70414 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc8a1P70414 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc8a1P70414 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc8a1P70414 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc8a1P70414 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc8a1P70414 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms