Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tp53bp1P70399 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tp53bp1P70399 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tp53bp1P70399 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tp53bp1P70399 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tp53bp1P70399 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tp53bp1P70399 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tp53bp1P70399 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tp53bp1P70399 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tp53bp1P70399 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tp53bp1P70399 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tp53bp1P70399 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tp53bp1P70399 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tp53bp1P70399 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tp53bp1P70399 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tp53bp1P70399 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tp53bp1P70399 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tp53bp1P70399 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tp53bp1P70399 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tp53bp1P70399 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tp53bp1P70399 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tp53bp1P70399 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tp53bp1P70399 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tp53bp1P70399 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tp53bp1P70399 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tp53bp1P70399 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tp53bp1P70399 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tp53bp1P70399 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tp53bp1P70399 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tp53bp1P70399 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tp53bp1P70399 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tp53bp1P70399 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tp53bp1P70399 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tp53bp1P70399 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tp53bp1P70399 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tp53bp1P70399 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tp53bp1P70399 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tp53bp1P70399 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tp53bp1P70399 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tp53bp1P70399 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tp53bp1P70399 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tp53bp1P70399 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tp53bp1P70399 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tp53bp1P70399 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tp53bp1P70399 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tp53bp1P70399 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tp53bp1P70399 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tp53bp1P70399 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tp53bp1P70399 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tp53bp1P70399 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tp53bp1P70399 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tp53bp1P70399 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tp53bp1P70399 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tp53bp1P70399 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tp53bp1P70399 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tp53bp1P70399 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tp53bp1P70399 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tp53bp1P70399 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tp53bp1P70399 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tp53bp1P70399 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tp53bp1P70399 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tp53bp1P70399 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tp53bp1P70399 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tp53bp1P70399 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tp53bp1P70399 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tp53bp1P70399 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tp53bp1P70399 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tp53bp1P70399 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tp53bp1P70399 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tp53bp1P70399 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tp53bp1P70399 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tp53bp1P70399 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tp53bp1P70399 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tp53bp1P70399 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tp53bp1P70399 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tp53bp1P70399 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tp53bp1P70399 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tp53bp1P70399 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tp53bp1P70399 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tp53bp1P70399 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tp53bp1P70399 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tp53bp1P70399 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tp53bp1P70399 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tp53bp1P70399 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tp53bp1P70399 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tp53bp1P70399 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tp53bp1P70399 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tp53bp1P70399 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tp53bp1P70399 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tp53bp1P70399 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tp53bp1P70399 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tp53bp1P70399 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tp53bp1P70399 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tp53bp1P70399 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tp53bp1P70399 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tp53bp1P70399 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tp53bp1P70399 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tp53bp1P70399 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tp53bp1P70399 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tp53bp1P70399 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms