Protein–RNA interactions for Protein: P70343

Casp4, Caspase-4, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp4P70343 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Casp4P70343 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casp4P70343 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casp4P70343 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casp4P70343 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casp4P70343 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casp4P70343 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casp4P70343 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casp4P70343 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casp4P70343 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casp4P70343 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casp4P70343 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casp4P70343 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casp4P70343 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Casp4P70343 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casp4P70343 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casp4P70343 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casp4P70343 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casp4P70343 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casp4P70343 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Casp4P70343 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Casp4P70343 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Casp4P70343 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casp4P70343 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casp4P70343 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casp4P70343 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casp4P70343 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casp4P70343 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casp4P70343 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casp4P70343 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casp4P70343 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casp4P70343 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casp4P70343 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casp4P70343 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casp4P70343 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casp4P70343 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casp4P70343 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Casp4P70343 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casp4P70343 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casp4P70343 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casp4P70343 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casp4P70343 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casp4P70343 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Casp4P70343 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casp4P70343 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casp4P70343 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Casp4P70343 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casp4P70343 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casp4P70343 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Casp4P70343 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Casp4P70343 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Casp4P70343 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Casp4P70343 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casp4P70343 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casp4P70343 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casp4P70343 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casp4P70343 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casp4P70343 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casp4P70343 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casp4P70343 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Casp4P70343 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casp4P70343 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casp4P70343 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casp4P70343 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casp4P70343 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casp4P70343 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casp4P70343 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casp4P70343 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casp4P70343 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casp4P70343 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casp4P70343 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casp4P70343 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casp4P70343 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casp4P70343 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casp4P70343 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casp4P70343 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp4P70343 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp4P70343 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp4P70343 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp4P70343 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp4P70343 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp4P70343 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp4P70343 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp4P70343 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp4P70343 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp4P70343 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp4P70343 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp4P70343 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp4P70343 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp4P70343 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp4P70343 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Casp4P70343 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Casp4P70343 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Casp4P70343 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Casp4P70343 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casp4P70343 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casp4P70343 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casp4P70343 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casp4P70343 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casp4P70343 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.2 ms