Protein–RNA interactions for Protein: P70288

Hdac2, Histone deacetylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac2P70288 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac2P70288 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac2P70288 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac2P70288 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac2P70288 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac2P70288 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac2P70288 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac2P70288 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac2P70288 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac2P70288 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdac2P70288 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdac2P70288 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdac2P70288 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdac2P70288 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdac2P70288 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdac2P70288 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdac2P70288 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdac2P70288 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdac2P70288 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdac2P70288 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac2P70288 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac2P70288 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdac2P70288 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hdac2P70288 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdac2P70288 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdac2P70288 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdac2P70288 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdac2P70288 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdac2P70288 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdac2P70288 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdac2P70288 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdac2P70288 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdac2P70288 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdac2P70288 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdac2P70288 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdac2P70288 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdac2P70288 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdac2P70288 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdac2P70288 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdac2P70288 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hdac2P70288 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hdac2P70288 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hdac2P70288 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdac2P70288 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdac2P70288 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdac2P70288 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hdac2P70288 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hdac2P70288 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdac2P70288 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdac2P70288 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdac2P70288 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdac2P70288 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdac2P70288 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdac2P70288 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdac2P70288 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac2P70288 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac2P70288 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac2P70288 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac2P70288 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac2P70288 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdac2P70288 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac2P70288 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac2P70288 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac2P70288 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac2P70288 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac2P70288 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac2P70288 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdac2P70288 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac2P70288 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac2P70288 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac2P70288 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdac2P70288 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac2P70288 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac2P70288 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac2P70288 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac2P70288 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac2P70288 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdac2P70288 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdac2P70288 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdac2P70288 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdac2P70288 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdac2P70288 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdac2P70288 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdac2P70288 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdac2P70288 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdac2P70288 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdac2P70288 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdac2P70288 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdac2P70288 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdac2P70288 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdac2P70288 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdac2P70288 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdac2P70288 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdac2P70288 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdac2P70288 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdac2P70288 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdac2P70288 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdac2P70288 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdac2P70288 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdac2P70288 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms