Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntn5P68500 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cntn5P68500 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntn5P68500 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntn5P68500 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntn5P68500 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntn5P68500 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntn5P68500 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntn5P68500 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cntn5P68500 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntn5P68500 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntn5P68500 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntn5P68500 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntn5P68500 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cntn5P68500 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntn5P68500 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntn5P68500 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntn5P68500 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntn5P68500 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntn5P68500 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntn5P68500 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntn5P68500 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntn5P68500 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntn5P68500 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntn5P68500 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntn5P68500 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntn5P68500 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntn5P68500 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntn5P68500 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntn5P68500 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntn5P68500 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntn5P68500 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntn5P68500 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntn5P68500 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntn5P68500 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntn5P68500 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntn5P68500 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntn5P68500 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cntn5P68500 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntn5P68500 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntn5P68500 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntn5P68500 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntn5P68500 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntn5P68500 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntn5P68500 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntn5P68500 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntn5P68500 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntn5P68500 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntn5P68500 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntn5P68500 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntn5P68500 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntn5P68500 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntn5P68500 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntn5P68500 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntn5P68500 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntn5P68500 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntn5P68500 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntn5P68500 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntn5P68500 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntn5P68500 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntn5P68500 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntn5P68500 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntn5P68500 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntn5P68500 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntn5P68500 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntn5P68500 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntn5P68500 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntn5P68500 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntn5P68500 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntn5P68500 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntn5P68500 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntn5P68500 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntn5P68500 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntn5P68500 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntn5P68500 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cntn5P68500 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cntn5P68500 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cntn5P68500 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cntn5P68500 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntn5P68500 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntn5P68500 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntn5P68500 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntn5P68500 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntn5P68500 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntn5P68500 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntn5P68500 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntn5P68500 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntn5P68500 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntn5P68500 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntn5P68500 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntn5P68500 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntn5P68500 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntn5P68500 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntn5P68500 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntn5P68500 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntn5P68500 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntn5P68500 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntn5P68500 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntn5P68500 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntn5P68500 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms