Protein–RNA interactions for Protein: P62915

Gtf2b, Transcription initiation factor IIB, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2bP62915 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf2bP62915 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf2bP62915 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf2bP62915 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2bP62915 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2bP62915 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2bP62915 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2bP62915 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2bP62915 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2bP62915 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2bP62915 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2bP62915 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf2bP62915 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf2bP62915 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf2bP62915 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf2bP62915 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf2bP62915 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf2bP62915 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf2bP62915 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf2bP62915 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf2bP62915 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf2bP62915 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf2bP62915 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf2bP62915 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf2bP62915 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf2bP62915 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf2bP62915 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf2bP62915 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf2bP62915 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf2bP62915 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf2bP62915 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf2bP62915 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf2bP62915 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf2bP62915 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf2bP62915 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf2bP62915 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf2bP62915 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf2bP62915 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2bP62915 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2bP62915 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2bP62915 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf2bP62915 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf2bP62915 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf2bP62915 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf2bP62915 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf2bP62915 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf2bP62915 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2bP62915 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2bP62915 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2bP62915 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2bP62915 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2bP62915 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2bP62915 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2bP62915 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2bP62915 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2bP62915 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Gtf2bP62915 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2bP62915 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2bP62915 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2bP62915 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2bP62915 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2bP62915 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtf2bP62915 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf2bP62915 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf2bP62915 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf2bP62915 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf2bP62915 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtf2bP62915 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf2bP62915 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf2bP62915 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf2bP62915 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf2bP62915 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf2bP62915 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtf2bP62915 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf2bP62915 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf2bP62915 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf2bP62915 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf2bP62915 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf2bP62915 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gtf2bP62915 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf2bP62915 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf2bP62915 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf2bP62915 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gtf2bP62915 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2bP62915 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2bP62915 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2bP62915 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gtf2bP62915 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Gtf2bP62915 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf2bP62915 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf2bP62915 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf2bP62915 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf2bP62915 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gtf2bP62915 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf2bP62915 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf2bP62915 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf2bP62915 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf2bP62915 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf2bP62915 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gtf2bP62915 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms