Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lsm3P62311 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lsm3P62311 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lsm3P62311 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lsm3P62311 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lsm3P62311 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lsm3P62311 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lsm3P62311 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lsm3P62311 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lsm3P62311 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Lsm3P62311 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lsm3P62311 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lsm3P62311 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lsm3P62311 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lsm3P62311 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lsm3P62311 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lsm3P62311 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lsm3P62311 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lsm3P62311 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lsm3P62311 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lsm3P62311 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lsm3P62311 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lsm3P62311 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lsm3P62311 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lsm3P62311 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lsm3P62311 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lsm3P62311 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lsm3P62311 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lsm3P62311 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lsm3P62311 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lsm3P62311 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lsm3P62311 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lsm3P62311 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lsm3P62311 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lsm3P62311 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lsm3P62311 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lsm3P62311 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lsm3P62311 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lsm3P62311 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lsm3P62311 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lsm3P62311 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lsm3P62311 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lsm3P62311 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lsm3P62311 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lsm3P62311 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lsm3P62311 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lsm3P62311 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lsm3P62311 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lsm3P62311 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lsm3P62311 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lsm3P62311 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lsm3P62311 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lsm3P62311 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lsm3P62311 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lsm3P62311 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lsm3P62311 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lsm3P62311 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lsm3P62311 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lsm3P62311 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lsm3P62311 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lsm3P62311 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lsm3P62311 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lsm3P62311 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lsm3P62311 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lsm3P62311 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lsm3P62311 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lsm3P62311 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lsm3P62311 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lsm3P62311 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lsm3P62311 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lsm3P62311 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lsm3P62311 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lsm3P62311 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lsm3P62311 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lsm3P62311 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lsm3P62311 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lsm3P62311 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lsm3P62311 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lsm3P62311 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lsm3P62311 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lsm3P62311 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lsm3P62311 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lsm3P62311 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lsm3P62311 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lsm3P62311 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lsm3P62311 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lsm3P62311 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lsm3P62311 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lsm3P62311 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lsm3P62311 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lsm3P62311 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lsm3P62311 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lsm3P62311 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lsm3P62311 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lsm3P62311 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lsm3P62311 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lsm3P62311 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lsm3P62311 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lsm3P62311 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lsm3P62311 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms