Protein–RNA interactions for Protein: P62305

Snrpe, Small nuclear ribonucleoprotein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpeP62305 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SnrpeP62305 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SnrpeP62305 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SnrpeP62305 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SnrpeP62305 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SnrpeP62305 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SnrpeP62305 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SnrpeP62305 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SnrpeP62305 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SnrpeP62305 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SnrpeP62305 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SnrpeP62305 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SnrpeP62305 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SnrpeP62305 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SnrpeP62305 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SnrpeP62305 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SnrpeP62305 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SnrpeP62305 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SnrpeP62305 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SnrpeP62305 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SnrpeP62305 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SnrpeP62305 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SnrpeP62305 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SnrpeP62305 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SnrpeP62305 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SnrpeP62305 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SnrpeP62305 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SnrpeP62305 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SnrpeP62305 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SnrpeP62305 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SnrpeP62305 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SnrpeP62305 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SnrpeP62305 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SnrpeP62305 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SnrpeP62305 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SnrpeP62305 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SnrpeP62305 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SnrpeP62305 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SnrpeP62305 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SnrpeP62305 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SnrpeP62305 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SnrpeP62305 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SnrpeP62305 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SnrpeP62305 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SnrpeP62305 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SnrpeP62305 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SnrpeP62305 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpeP62305 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpeP62305 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpeP62305 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SnrpeP62305 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpeP62305 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpeP62305 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpeP62305 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpeP62305 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SnrpeP62305 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpeP62305 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpeP62305 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpeP62305 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpeP62305 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpeP62305 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpeP62305 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SnrpeP62305 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SnrpeP62305 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SnrpeP62305 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms