Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ufm1P61961 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ufm1P61961 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ufm1P61961 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ufm1P61961 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ufm1P61961 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ufm1P61961 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ufm1P61961 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ufm1P61961 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ufm1P61961 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ufm1P61961 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ufm1P61961 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ufm1P61961 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ufm1P61961 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ufm1P61961 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ufm1P61961 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ufm1P61961 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ufm1P61961 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ufm1P61961 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ufm1P61961 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ufm1P61961 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ufm1P61961 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ufm1P61961 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ufm1P61961 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ufm1P61961 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ufm1P61961 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ufm1P61961 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ufm1P61961 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ufm1P61961 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ufm1P61961 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ufm1P61961 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ufm1P61961 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ufm1P61961 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ufm1P61961 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ufm1P61961 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ufm1P61961 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ufm1P61961 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ufm1P61961 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ufm1P61961 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ufm1P61961 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ufm1P61961 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ufm1P61961 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ufm1P61961 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ufm1P61961 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ufm1P61961 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ufm1P61961 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ufm1P61961 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ufm1P61961 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ufm1P61961 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ufm1P61961 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ufm1P61961 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ufm1P61961 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ufm1P61961 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ufm1P61961 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ufm1P61961 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ufm1P61961 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ufm1P61961 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ufm1P61961 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ufm1P61961 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ufm1P61961 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ufm1P61961 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ufm1P61961 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ufm1P61961 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ufm1P61961 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ufm1P61961 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ufm1P61961 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ufm1P61961 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ufm1P61961 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ufm1P61961 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ufm1P61961 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ufm1P61961 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ufm1P61961 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ufm1P61961 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ufm1P61961 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ufm1P61961 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ufm1P61961 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ufm1P61961 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ufm1P61961 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ufm1P61961 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ufm1P61961 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ufm1P61961 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ufm1P61961 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ufm1P61961 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ufm1P61961 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ufm1P61961 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ufm1P61961 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ufm1P61961 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ufm1P61961 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ufm1P61961 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ufm1P61961 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ufm1P61961 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ufm1P61961 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ufm1P61961 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ufm1P61961 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ufm1P61961 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ufm1P61961 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ufm1P61961 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ufm1P61961 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ufm1P61961 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ufm1P61961 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 624.8 ms