Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CirbpP60824 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CirbpP60824 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CirbpP60824 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CirbpP60824 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CirbpP60824 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CirbpP60824 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CirbpP60824 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CirbpP60824 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CirbpP60824 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CirbpP60824 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms