Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3bp1P55194 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3bp1P55194 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3bp1P55194 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3bp1P55194 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3bp1P55194 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3bp1P55194 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh3bp1P55194 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sh3bp1P55194 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3bp1P55194 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3bp1P55194 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3bp1P55194 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3bp1P55194 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3bp1P55194 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3bp1P55194 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3bp1P55194 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3bp1P55194 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3bp1P55194 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3bp1P55194 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3bp1P55194 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3bp1P55194 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3bp1P55194 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3bp1P55194 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3bp1P55194 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3bp1P55194 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3bp1P55194 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3bp1P55194 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3bp1P55194 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3bp1P55194 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3bp1P55194 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3bp1P55194 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3bp1P55194 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3bp1P55194 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3bp1P55194 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3bp1P55194 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3bp1P55194 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3bp1P55194 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3bp1P55194 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3bp1P55194 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3bp1P55194 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3bp1P55194 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3bp1P55194 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3bp1P55194 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3bp1P55194 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3bp1P55194 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3bp1P55194 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3bp1P55194 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3bp1P55194 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3bp1P55194 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3bp1P55194 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3bp1P55194 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3bp1P55194 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3bp1P55194 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3bp1P55194 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3bp1P55194 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3bp1P55194 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3bp1P55194 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3bp1P55194 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3bp1P55194 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3bp1P55194 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3bp1P55194 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3bp1P55194 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3bp1P55194 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3bp1P55194 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3bp1P55194 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3bp1P55194 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3bp1P55194 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3bp1P55194 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3bp1P55194 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3bp1P55194 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3bp1P55194 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3bp1P55194 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Sh3bp1P55194 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sh3bp1P55194 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3bp1P55194 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3bp1P55194 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3bp1P55194 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3bp1P55194 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3bp1P55194 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3bp1P55194 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3bp1P55194 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3bp1P55194 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3bp1P55194 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3bp1P55194 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3bp1P55194 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3bp1P55194 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3bp1P55194 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3bp1P55194 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sh3bp1P55194 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh3bp1P55194 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh3bp1P55194 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh3bp1P55194 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh3bp1P55194 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh3bp1P55194 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh3bp1P55194 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh3bp1P55194 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh3bp1P55194 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh3bp1P55194 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh3bp1P55194 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh3bp1P55194 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms