Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slc12a1P55014 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc12a1P55014 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc12a1P55014 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc12a1P55014 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc12a1P55014 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc12a1P55014 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slc12a1P55014 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc12a1P55014 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc12a1P55014 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slc12a1P55014 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc12a1P55014 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc12a1P55014 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc12a1P55014 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slc12a1P55014 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc12a1P55014 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc12a1P55014 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slc12a1P55014 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc12a1P55014 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc12a1P55014 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc12a1P55014 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc12a1P55014 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc12a1P55014 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc12a1P55014 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc12a1P55014 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc12a1P55014 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc12a1P55014 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slc12a1P55014 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc12a1P55014 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc12a1P55014 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc12a1P55014 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc12a1P55014 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc12a1P55014 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc12a1P55014 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc12a1P55014 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc12a1P55014 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc12a1P55014 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc12a1P55014 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc12a1P55014 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc12a1P55014 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc12a1P55014 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc12a1P55014 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc12a1P55014 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc12a1P55014 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc12a1P55014 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc12a1P55014 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc12a1P55014 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc12a1P55014 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc12a1P55014 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc12a1P55014 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc12a1P55014 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc12a1P55014 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc12a1P55014 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc12a1P55014 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc12a1P55014 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc12a1P55014 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc12a1P55014 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc12a1P55014 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc12a1P55014 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc12a1P55014 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc12a1P55014 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc12a1P55014 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc12a1P55014 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc12a1P55014 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc12a1P55014 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc12a1P55014 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc12a1P55014 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc12a1P55014 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc12a1P55014 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc12a1P55014 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc12a1P55014 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc12a1P55014 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc12a1P55014 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc12a1P55014 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc12a1P55014 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc12a1P55014 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc12a1P55014 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc12a1P55014 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc12a1P55014 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc12a1P55014 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc12a1P55014 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc12a1P55014 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc12a1P55014 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc12a1P55014 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc12a1P55014 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc12a1P55014 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc12a1P55014 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc12a1P55014 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc12a1P55014 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc12a1P55014 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc12a1P55014 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc12a1P55014 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc12a1P55014 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc12a1P55014 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc12a1P55014 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc12a1P55014 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc12a1P55014 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc12a1P55014 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc12a1P55014 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc12a1P55014 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms