Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Acod1P54987 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Acod1P54987 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Acod1P54987 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Acod1P54987 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Acod1P54987 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Acod1P54987 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Acod1P54987 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Acod1P54987 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Acod1P54987 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acod1P54987 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acod1P54987 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acod1P54987 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acod1P54987 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acod1P54987 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Acod1P54987 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Acod1P54987 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Acod1P54987 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Acod1P54987 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Acod1P54987 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Acod1P54987 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Acod1P54987 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Acod1P54987 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Acod1P54987 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Acod1P54987 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Acod1P54987 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Acod1P54987 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Acod1P54987 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Acod1P54987 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Acod1P54987 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acod1P54987 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acod1P54987 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acod1P54987 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Acod1P54987 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Acod1P54987 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Acod1P54987 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Acod1P54987 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Acod1P54987 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Acod1P54987 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Acod1P54987 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Acod1P54987 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Acod1P54987 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Acod1P54987 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Acod1P54987 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Acod1P54987 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Acod1P54987 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Acod1P54987 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Acod1P54987 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Acod1P54987 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Acod1P54987 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Acod1P54987 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Acod1P54987 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Acod1P54987 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Acod1P54987 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Acod1P54987 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Acod1P54987 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Acod1P54987 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Acod1P54987 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Acod1P54987 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Acod1P54987 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Acod1P54987 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Acod1P54987 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Acod1P54987 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Acod1P54987 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Acod1P54987 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Acod1P54987 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Acod1P54987 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Acod1P54987 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Acod1P54987 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Acod1P54987 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Acod1P54987 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Acod1P54987 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Acod1P54987 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Acod1P54987 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Acod1P54987 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acod1P54987 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acod1P54987 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acod1P54987 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acod1P54987 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acod1P54987 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acod1P54987 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acod1P54987 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acod1P54987 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acod1P54987 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acod1P54987 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acod1P54987 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acod1P54987 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acod1P54987 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acod1P54987 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acod1P54987 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acod1P54987 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acod1P54987 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Acod1P54987 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acod1P54987 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Acod1P54987 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acod1P54987 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acod1P54987 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acod1P54987 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Acod1P54987 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Acod1P54987 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms