Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa11P50709 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa11P50709 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa11P50709 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa11P50709 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa11P50709 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa11P50709 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa11P50709 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa11P50709 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa11P50709 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa11P50709 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa11P50709 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa11P50709 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa11P50709 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Defa11P50709 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Defa11P50709 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Defa11P50709 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Defa11P50709 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Defa11P50709 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Defa11P50709 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa11P50709 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa11P50709 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa11P50709 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa11P50709 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa11P50709 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa11P50709 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa11P50709 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa11P50709 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa11P50709 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa11P50709 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa11P50709 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa11P50709 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa11P50709 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa11P50709 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa11P50709 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa11P50709 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa11P50709 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa11P50709 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa11P50709 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa11P50709 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa11P50709 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa11P50709 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa11P50709 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa11P50709 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa11P50709 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa11P50709 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa11P50709 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa11P50709 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa11P50709 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa11P50709 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Defa11P50709 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa11P50709 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa11P50709 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa11P50709 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa11P50709 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa11P50709 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa11P50709 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa11P50709 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa11P50709 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa11P50709 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa11P50709 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa11P50709 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa11P50709 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa11P50709 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Defa11P50709 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Defa11P50709 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa11P50709 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa11P50709 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa11P50709 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Defa11P50709 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa11P50709 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa11P50709 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa11P50709 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa11P50709 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa11P50709 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa11P50709 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa11P50709 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa11P50709 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa11P50709 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa11P50709 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa11P50709 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa11P50709 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa11P50709 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa11P50709 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa11P50709 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa11P50709 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa11P50709 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa11P50709 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa11P50709 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Defa11P50709 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa11P50709 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms