Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxc13P50207 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxc13P50207 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxc13P50207 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxc13P50207 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxc13P50207 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxc13P50207 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxc13P50207 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxc13P50207 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxc13P50207 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxc13P50207 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxc13P50207 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxc13P50207 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxc13P50207 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxc13P50207 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxc13P50207 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxc13P50207 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxc13P50207 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Hoxc13P50207 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxc13P50207 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxc13P50207 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxc13P50207 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxc13P50207 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxc13P50207 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxc13P50207 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxc13P50207 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxc13P50207 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxc13P50207 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxc13P50207 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxc13P50207 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxc13P50207 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxc13P50207 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxc13P50207 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxc13P50207 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxc13P50207 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxc13P50207 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxc13P50207 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxc13P50207 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxc13P50207 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxc13P50207 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxc13P50207 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxc13P50207 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxc13P50207 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxc13P50207 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxc13P50207 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxc13P50207 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxc13P50207 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxc13P50207 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxc13P50207 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxc13P50207 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxc13P50207 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxc13P50207 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxc13P50207 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxc13P50207 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxc13P50207 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxc13P50207 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxc13P50207 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxc13P50207 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxc13P50207 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxc13P50207 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxc13P50207 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxc13P50207 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxc13P50207 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxc13P50207 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxc13P50207 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxc13P50207 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxc13P50207 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxc13P50207 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxc13P50207 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxc13P50207 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxc13P50207 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxc13P50207 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxc13P50207 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxc13P50207 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxc13P50207 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxc13P50207 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hoxc13P50207 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hoxc13P50207 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxc13P50207 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxc13P50207 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxc13P50207 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxc13P50207 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxc13P50207 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxc13P50207 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxc13P50207 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxc13P50207 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxc13P50207 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxc13P50207 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxc13P50207 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxc13P50207 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxc13P50207 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxc13P50207 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxc13P50207 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxc13P50207 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxc13P50207 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxc13P50207 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxc13P50207 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxc13P50207 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxc13P50207 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxc13P50207 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms