Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmod1P49813 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmod1P49813 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmod1P49813 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmod1P49813 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmod1P49813 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmod1P49813 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmod1P49813 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmod1P49813 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmod1P49813 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmod1P49813 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmod1P49813 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmod1P49813 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmod1P49813 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmod1P49813 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmod1P49813 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmod1P49813 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmod1P49813 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmod1P49813 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmod1P49813 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmod1P49813 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmod1P49813 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmod1P49813 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmod1P49813 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmod1P49813 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmod1P49813 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmod1P49813 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmod1P49813 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmod1P49813 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmod1P49813 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmod1P49813 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmod1P49813 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmod1P49813 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmod1P49813 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmod1P49813 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmod1P49813 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmod1P49813 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmod1P49813 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmod1P49813 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmod1P49813 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmod1P49813 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmod1P49813 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmod1P49813 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmod1P49813 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tmod1P49813 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmod1P49813 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmod1P49813 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmod1P49813 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmod1P49813 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmod1P49813 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmod1P49813 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmod1P49813 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmod1P49813 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmod1P49813 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmod1P49813 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmod1P49813 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmod1P49813 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmod1P49813 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmod1P49813 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmod1P49813 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmod1P49813 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmod1P49813 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmod1P49813 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmod1P49813 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmod1P49813 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmod1P49813 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmod1P49813 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmod1P49813 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmod1P49813 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmod1P49813 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmod1P49813 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmod1P49813 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmod1P49813 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmod1P49813 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmod1P49813 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmod1P49813 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmod1P49813 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmod1P49813 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmod1P49813 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmod1P49813 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmod1P49813 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmod1P49813 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmod1P49813 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmod1P49813 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmod1P49813 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmod1P49813 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmod1P49813 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmod1P49813 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmod1P49813 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmod1P49813 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmod1P49813 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmod1P49813 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmod1P49813 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmod1P49813 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmod1P49813 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmod1P49813 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmod1P49813 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmod1P49813 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmod1P49813 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmod1P49813 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms