Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ercc3P49135 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ercc3P49135 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ercc3P49135 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ercc3P49135 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ercc3P49135 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ercc3P49135 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ercc3P49135 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ercc3P49135 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ercc3P49135 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ercc3P49135 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ercc3P49135 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ercc3P49135 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ercc3P49135 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ercc3P49135 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ercc3P49135 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ercc3P49135 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ercc3P49135 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ercc3P49135 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ercc3P49135 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ercc3P49135 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ercc3P49135 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ercc3P49135 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ercc3P49135 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ercc3P49135 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ercc3P49135 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ercc3P49135 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ercc3P49135 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ercc3P49135 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ercc3P49135 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ercc3P49135 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ercc3P49135 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ercc3P49135 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ercc3P49135 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ercc3P49135 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ercc3P49135 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ercc3P49135 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ercc3P49135 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ercc3P49135 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ercc3P49135 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ercc3P49135 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ercc3P49135 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ercc3P49135 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ercc3P49135 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ercc3P49135 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ercc3P49135 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ercc3P49135 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ercc3P49135 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ercc3P49135 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ercc3P49135 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ercc3P49135 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ercc3P49135 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ercc3P49135 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ercc3P49135 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Ercc3P49135 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ercc3P49135 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ercc3P49135 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ercc3P49135 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ercc3P49135 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ercc3P49135 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ercc3P49135 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ercc3P49135 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ercc3P49135 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ercc3P49135 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ercc3P49135 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ercc3P49135 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ercc3P49135 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ercc3P49135 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ercc3P49135 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ercc3P49135 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ercc3P49135 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ercc3P49135 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ercc3P49135 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ercc3P49135 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ercc3P49135 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ercc3P49135 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ercc3P49135 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ercc3P49135 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ercc3P49135 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ercc3P49135 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ercc3P49135 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ercc3P49135 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ercc3P49135 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ercc3P49135 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ercc3P49135 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ercc3P49135 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ercc3P49135 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ercc3P49135 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ercc3P49135 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ercc3P49135 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ercc3P49135 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ercc3P49135 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ercc3P49135 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ercc3P49135 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ercc3P49135 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ercc3P49135 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ercc3P49135 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ercc3P49135 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ercc3P49135 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ercc3P49135 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms