Protein–RNA interactions for Protein: P48986

Neurod6, Neurogenic differentiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod6P48986 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Neurod6P48986 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Neurod6P48986 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Neurod6P48986 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Neurod6P48986 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Neurod6P48986 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Neurod6P48986 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Neurod6P48986 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Neurod6P48986 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Neurod6P48986 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Neurod6P48986 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Neurod6P48986 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Neurod6P48986 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Neurod6P48986 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Neurod6P48986 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Neurod6P48986 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Neurod6P48986 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Neurod6P48986 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Neurod6P48986 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Neurod6P48986 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Neurod6P48986 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Neurod6P48986 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Neurod6P48986 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Neurod6P48986 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Neurod6P48986 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Neurod6P48986 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Neurod6P48986 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Neurod6P48986 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Neurod6P48986 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Neurod6P48986 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Neurod6P48986 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Neurod6P48986 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Neurod6P48986 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Neurod6P48986 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Neurod6P48986 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Neurod6P48986 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Neurod6P48986 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Neurod6P48986 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Neurod6P48986 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Neurod6P48986 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Neurod6P48986 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Neurod6P48986 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Neurod6P48986 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Neurod6P48986 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Neurod6P48986 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Neurod6P48986 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Neurod6P48986 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Neurod6P48986 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Neurod6P48986 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Neurod6P48986 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Neurod6P48986 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Neurod6P48986 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Neurod6P48986 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Neurod6P48986 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Neurod6P48986 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Neurod6P48986 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Neurod6P48986 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Neurod6P48986 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Neurod6P48986 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Neurod6P48986 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Neurod6P48986 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Neurod6P48986 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Neurod6P48986 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Neurod6P48986 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Neurod6P48986 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Neurod6P48986 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Neurod6P48986 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Neurod6P48986 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Neurod6P48986 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Neurod6P48986 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Neurod6P48986 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Neurod6P48986 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Neurod6P48986 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Neurod6P48986 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Neurod6P48986 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Neurod6P48986 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Neurod6P48986 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Neurod6P48986 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Neurod6P48986 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Neurod6P48986 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Neurod6P48986 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Neurod6P48986 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Neurod6P48986 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Neurod6P48986 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Neurod6P48986 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Neurod6P48986 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Neurod6P48986 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Neurod6P48986 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Neurod6P48986 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Neurod6P48986 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Neurod6P48986 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Neurod6P48986 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Neurod6P48986 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Neurod6P48986 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Neurod6P48986 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Neurod6P48986 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Neurod6P48986 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Neurod6P48986 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Neurod6P48986 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Neurod6P48986 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms