Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Brca1P48754 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Brca1P48754 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Brca1P48754 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Brca1P48754 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Brca1P48754 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Brca1P48754 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Brca1P48754 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Brca1P48754 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brca1P48754 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brca1P48754 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brca1P48754 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brca1P48754 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brca1P48754 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brca1P48754 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Brca1P48754 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brca1P48754 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brca1P48754 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Brca1P48754 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brca1P48754 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brca1P48754 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brca1P48754 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Brca1P48754 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Brca1P48754 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Brca1P48754 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Brca1P48754 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Brca1P48754 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Brca1P48754 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brca1P48754 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brca1P48754 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Brca1P48754 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Brca1P48754 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Brca1P48754 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Brca1P48754 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Brca1P48754 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Brca1P48754 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Brca1P48754 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Brca1P48754 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Brca1P48754 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Brca1P48754 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Brca1P48754 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Brca1P48754 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Brca1P48754 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brca1P48754 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brca1P48754 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brca1P48754 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brca1P48754 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brca1P48754 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brca1P48754 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brca1P48754 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brca1P48754 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brca1P48754 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brca1P48754 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brca1P48754 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Brca1P48754 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brca1P48754 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brca1P48754 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brca1P48754 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brca1P48754 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Brca1P48754 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Brca1P48754 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Brca1P48754 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Brca1P48754 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brca1P48754 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brca1P48754 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brca1P48754 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brca1P48754 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Brca1P48754 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Brca1P48754 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Brca1P48754 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Brca1P48754 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Brca1P48754 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Brca1P48754 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Brca1P48754 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Brca1P48754 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Brca1P48754 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Brca1P48754 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Brca1P48754 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Brca1P48754 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Brca1P48754 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brca1P48754 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brca1P48754 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brca1P48754 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brca1P48754 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brca1P48754 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Brca1P48754 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Brca1P48754 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Brca1P48754 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Brca1P48754 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Brca1P48754 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Brca1P48754 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Brca1P48754 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Brca1P48754 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Brca1P48754 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Brca1P48754 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Brca1P48754 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brca1P48754 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brca1P48754 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brca1P48754 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brca1P48754 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms