Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpl13P47963 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpl13P47963 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpl13P47963 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpl13P47963 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpl13P47963 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpl13P47963 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpl13P47963 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpl13P47963 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpl13P47963 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpl13P47963 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpl13P47963 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpl13P47963 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpl13P47963 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpl13P47963 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpl13P47963 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpl13P47963 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpl13P47963 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rpl13P47963 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rpl13P47963 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rpl13P47963 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rpl13P47963 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rpl13P47963 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpl13P47963 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpl13P47963 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpl13P47963 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpl13P47963 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpl13P47963 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpl13P47963 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpl13P47963 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpl13P47963 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpl13P47963 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpl13P47963 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpl13P47963 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpl13P47963 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpl13P47963 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpl13P47963 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpl13P47963 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpl13P47963 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpl13P47963 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpl13P47963 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpl13P47963 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpl13P47963 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpl13P47963 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpl13P47963 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpl13P47963 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpl13P47963 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpl13P47963 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpl13P47963 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpl13P47963 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpl13P47963 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpl13P47963 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpl13P47963 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpl13P47963 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpl13P47963 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpl13P47963 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpl13P47963 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpl13P47963 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpl13P47963 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpl13P47963 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpl13P47963 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpl13P47963 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpl13P47963 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpl13P47963 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpl13P47963 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpl13P47963 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpl13P47963 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpl13P47963 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpl13P47963 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpl13P47963 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpl13P47963 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpl13P47963 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpl13P47963 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpl13P47963 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpl13P47963 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpl13P47963 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpl13P47963 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpl13P47963 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpl13P47963 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpl13P47963 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpl13P47963 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpl13P47963 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpl13P47963 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpl13P47963 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpl13P47963 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpl13P47963 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpl13P47963 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpl13P47963 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpl13P47963 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpl13P47963 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpl13P47963 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpl13P47963 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpl13P47963 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpl13P47963 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpl13P47963 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpl13P47963 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpl13P47963 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpl13P47963 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpl13P47963 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpl13P47963 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms