Protein–RNA interactions for Protein: P46467

Vps4b, Vacuolar protein sorting-associated protein 4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4bP46467 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps4bP46467 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps4bP46467 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps4bP46467 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps4bP46467 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps4bP46467 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps4bP46467 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps4bP46467 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps4bP46467 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps4bP46467 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps4bP46467 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps4bP46467 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps4bP46467 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps4bP46467 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps4bP46467 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps4bP46467 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps4bP46467 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps4bP46467 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps4bP46467 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps4bP46467 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps4bP46467 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps4bP46467 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps4bP46467 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps4bP46467 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps4bP46467 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps4bP46467 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps4bP46467 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps4bP46467 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps4bP46467 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps4bP46467 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps4bP46467 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps4bP46467 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps4bP46467 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps4bP46467 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps4bP46467 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps4bP46467 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps4bP46467 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps4bP46467 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps4bP46467 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps4bP46467 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps4bP46467 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps4bP46467 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps4bP46467 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps4bP46467 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps4bP46467 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps4bP46467 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps4bP46467 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps4bP46467 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps4bP46467 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps4bP46467 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps4bP46467 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps4bP46467 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps4bP46467 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps4bP46467 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps4bP46467 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps4bP46467 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps4bP46467 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps4bP46467 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps4bP46467 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps4bP46467 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps4bP46467 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps4bP46467 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps4bP46467 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps4bP46467 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps4bP46467 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps4bP46467 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps4bP46467 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps4bP46467 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps4bP46467 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Vps4bP46467 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps4bP46467 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps4bP46467 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps4bP46467 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps4bP46467 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps4bP46467 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps4bP46467 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps4bP46467 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps4bP46467 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps4bP46467 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps4bP46467 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps4bP46467 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps4bP46467 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps4bP46467 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps4bP46467 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps4bP46467 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps4bP46467 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps4bP46467 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps4bP46467 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps4bP46467 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps4bP46467 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps4bP46467 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps4bP46467 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps4bP46467 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps4bP46467 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps4bP46467 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps4bP46467 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps4bP46467 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps4bP46467 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps4bP46467 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps4bP46467 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms