Protein–RNA interactions for Protein: P43006

Slc1a2, Excitatory amino acid transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a2P43006 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc1a2P43006 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc1a2P43006 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc1a2P43006 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc1a2P43006 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc1a2P43006 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc1a2P43006 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc1a2P43006 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc1a2P43006 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc1a2P43006 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc1a2P43006 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc1a2P43006 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc1a2P43006 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc1a2P43006 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc1a2P43006 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc1a2P43006 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc1a2P43006 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc1a2P43006 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc1a2P43006 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc1a2P43006 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc1a2P43006 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc1a2P43006 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc1a2P43006 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc1a2P43006 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc1a2P43006 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc1a2P43006 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc1a2P43006 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc1a2P43006 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc1a2P43006 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc1a2P43006 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc1a2P43006 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc1a2P43006 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc1a2P43006 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc1a2P43006 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc1a2P43006 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Slc1a2P43006 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc1a2P43006 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc1a2P43006 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc1a2P43006 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc1a2P43006 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc1a2P43006 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc1a2P43006 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc1a2P43006 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc1a2P43006 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc1a2P43006 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc1a2P43006 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc1a2P43006 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc1a2P43006 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc1a2P43006 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc1a2P43006 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc1a2P43006 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc1a2P43006 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc1a2P43006 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc1a2P43006 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc1a2P43006 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc1a2P43006 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc1a2P43006 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc1a2P43006 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc1a2P43006 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc1a2P43006 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc1a2P43006 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc1a2P43006 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc1a2P43006 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc1a2P43006 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc1a2P43006 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc1a2P43006 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc1a2P43006 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc1a2P43006 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc1a2P43006 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc1a2P43006 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc1a2P43006 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc1a2P43006 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc1a2P43006 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc1a2P43006 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc1a2P43006 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc1a2P43006 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc1a2P43006 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc1a2P43006 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc1a2P43006 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc1a2P43006 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc1a2P43006 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc1a2P43006 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc1a2P43006 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc1a2P43006 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc1a2P43006 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc1a2P43006 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc1a2P43006 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc1a2P43006 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc1a2P43006 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc1a2P43006 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc1a2P43006 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc1a2P43006 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc1a2P43006 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc1a2P43006 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc1a2P43006 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc1a2P43006 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc1a2P43006 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc1a2P43006 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc1a2P43006 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc1a2P43006 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.9 ms