Protein–RNA interactions for Protein: P41969

Elk1, ETS domain-containing protein Elk-1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk1P41969 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Elk1P41969 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Elk1P41969 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Elk1P41969 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Elk1P41969 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Elk1P41969 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Elk1P41969 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Elk1P41969 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Elk1P41969 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Elk1P41969 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Elk1P41969 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Elk1P41969 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Elk1P41969 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Elk1P41969 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Elk1P41969 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Elk1P41969 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Elk1P41969 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Elk1P41969 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Elk1P41969 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Elk1P41969 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Elk1P41969 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Elk1P41969 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Elk1P41969 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Elk1P41969 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Elk1P41969 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Elk1P41969 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Elk1P41969 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Elk1P41969 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Elk1P41969 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Elk1P41969 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Elk1P41969 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Elk1P41969 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Elk1P41969 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Elk1P41969 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Elk1P41969 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Elk1P41969 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Elk1P41969 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Elk1P41969 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Elk1P41969 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Elk1P41969 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Elk1P41969 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Elk1P41969 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Elk1P41969 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Elk1P41969 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Elk1P41969 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Elk1P41969 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Elk1P41969 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Elk1P41969 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Elk1P41969 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Elk1P41969 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Elk1P41969 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Elk1P41969 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Elk1P41969 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Elk1P41969 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Elk1P41969 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Elk1P41969 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Elk1P41969 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Elk1P41969 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Elk1P41969 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Elk1P41969 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Elk1P41969 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Elk1P41969 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Elk1P41969 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Elk1P41969 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Elk1P41969 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Elk1P41969 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Elk1P41969 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Elk1P41969 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Elk1P41969 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Elk1P41969 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Elk1P41969 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Elk1P41969 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Elk1P41969 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Elk1P41969 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Elk1P41969 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Elk1P41969 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Elk1P41969 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Elk1P41969 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Elk1P41969 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Elk1P41969 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Elk1P41969 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Elk1P41969 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Elk1P41969 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Elk1P41969 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Elk1P41969 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Elk1P41969 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Elk1P41969 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Elk1P41969 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Elk1P41969 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Elk1P41969 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Elk1P41969 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Elk1P41969 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Elk1P41969 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Elk1P41969 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Elk1P41969 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Elk1P41969 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Elk1P41969 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Elk1P41969 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Elk1P41969 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Elk1P41969 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms