Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TfamP40630 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TfamP40630 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TfamP40630 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TfamP40630 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TfamP40630 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TfamP40630 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TfamP40630 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TfamP40630 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TfamP40630 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TfamP40630 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TfamP40630 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TfamP40630 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TfamP40630 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TfamP40630 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TfamP40630 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TfamP40630 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TfamP40630 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TfamP40630 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TfamP40630 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TfamP40630 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TfamP40630 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TfamP40630 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TfamP40630 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TfamP40630 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TfamP40630 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TfamP40630 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TfamP40630 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TfamP40630 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TfamP40630 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TfamP40630 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TfamP40630 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TfamP40630 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TfamP40630 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TfamP40630 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TfamP40630 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TfamP40630 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TfamP40630 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TfamP40630 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TfamP40630 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TfamP40630 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TfamP40630 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TfamP40630 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TfamP40630 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TfamP40630 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TfamP40630 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TfamP40630 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TfamP40630 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TfamP40630 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
TfamP40630 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TfamP40630 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TfamP40630 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TfamP40630 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TfamP40630 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TfamP40630 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TfamP40630 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TfamP40630 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TfamP40630 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TfamP40630 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TfamP40630 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TfamP40630 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TfamP40630 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TfamP40630 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TfamP40630 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TfamP40630 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TfamP40630 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TfamP40630 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TfamP40630 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TfamP40630 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TfamP40630 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TfamP40630 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TfamP40630 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TfamP40630 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TfamP40630 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TfamP40630 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TfamP40630 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TfamP40630 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TfamP40630 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TfamP40630 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TfamP40630 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TfamP40630 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TfamP40630 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TfamP40630 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TfamP40630 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TfamP40630 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TfamP40630 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TfamP40630 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TfamP40630 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TfamP40630 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TfamP40630 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TfamP40630 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TfamP40630 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TfamP40630 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TfamP40630 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TfamP40630 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TfamP40630 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TfamP40630 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TfamP40630 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TfamP40630 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TfamP40630 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms