Protein–RNA interactions for Protein: P35343

Cxcr2, C-X-C chemokine receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr2P35343 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cxcr2P35343 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cxcr2P35343 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cxcr2P35343 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cxcr2P35343 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cxcr2P35343 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cxcr2P35343 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cxcr2P35343 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cxcr2P35343 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cxcr2P35343 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cxcr2P35343 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxcr2P35343 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxcr2P35343 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxcr2P35343 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxcr2P35343 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxcr2P35343 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxcr2P35343 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxcr2P35343 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxcr2P35343 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxcr2P35343 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxcr2P35343 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxcr2P35343 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cxcr2P35343 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cxcr2P35343 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cxcr2P35343 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cxcr2P35343 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cxcr2P35343 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cxcr2P35343 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcr2P35343 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcr2P35343 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcr2P35343 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcr2P35343 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcr2P35343 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxcr2P35343 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cxcr2P35343 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cxcr2P35343 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cxcr2P35343 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cxcr2P35343 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cxcr2P35343 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cxcr2P35343 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cxcr2P35343 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cxcr2P35343 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cxcr2P35343 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cxcr2P35343 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cxcr2P35343 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cxcr2P35343 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cxcr2P35343 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cxcr2P35343 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxcr2P35343 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxcr2P35343 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxcr2P35343 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxcr2P35343 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxcr2P35343 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxcr2P35343 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxcr2P35343 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cxcr2P35343 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cxcr2P35343 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cxcr2P35343 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cxcr2P35343 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cxcr2P35343 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cxcr2P35343 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cxcr2P35343 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cxcr2P35343 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcr2P35343 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcr2P35343 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcr2P35343 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcr2P35343 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcr2P35343 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcr2P35343 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcr2P35343 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxcr2P35343 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cxcr2P35343 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cxcr2P35343 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cxcr2P35343 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cxcr2P35343 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cxcr2P35343 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cxcr2P35343 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cxcr2P35343 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cxcr2P35343 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cxcr2P35343 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cxcr2P35343 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cxcr2P35343 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cxcr2P35343 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cxcr2P35343 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cxcr2P35343 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cxcr2P35343 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cxcr2P35343 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cxcr2P35343 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcr2P35343 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcr2P35343 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cxcr2P35343 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cxcr2P35343 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cxcr2P35343 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cxcr2P35343 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cxcr2P35343 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cxcr2P35343 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcr2P35343 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcr2P35343 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcr2P35343 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cxcr2P35343 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms