Protein–RNA interactions for Protein: P32507

Nectin2, Nectin-2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin2P32507 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nectin2P32507 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nectin2P32507 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nectin2P32507 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nectin2P32507 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nectin2P32507 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nectin2P32507 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nectin2P32507 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nectin2P32507 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nectin2P32507 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nectin2P32507 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nectin2P32507 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Nectin2P32507 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nectin2P32507 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nectin2P32507 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nectin2P32507 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nectin2P32507 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nectin2P32507 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nectin2P32507 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nectin2P32507 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nectin2P32507 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nectin2P32507 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nectin2P32507 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nectin2P32507 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nectin2P32507 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nectin2P32507 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nectin2P32507 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nectin2P32507 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nectin2P32507 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nectin2P32507 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nectin2P32507 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nectin2P32507 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nectin2P32507 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nectin2P32507 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nectin2P32507 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nectin2P32507 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nectin2P32507 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nectin2P32507 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nectin2P32507 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nectin2P32507 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nectin2P32507 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nectin2P32507 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nectin2P32507 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nectin2P32507 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Nectin2P32507 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nectin2P32507 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Nectin2P32507 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nectin2P32507 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nectin2P32507 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nectin2P32507 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nectin2P32507 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nectin2P32507 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nectin2P32507 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nectin2P32507 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nectin2P32507 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nectin2P32507 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Nectin2P32507 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nectin2P32507 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nectin2P32507 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nectin2P32507 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nectin2P32507 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nectin2P32507 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nectin2P32507 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nectin2P32507 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nectin2P32507 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nectin2P32507 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nectin2P32507 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nectin2P32507 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Nectin2P32507 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nectin2P32507 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nectin2P32507 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nectin2P32507 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nectin2P32507 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Nectin2P32507 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Nectin2P32507 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nectin2P32507 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nectin2P32507 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nectin2P32507 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nectin2P32507 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nectin2P32507 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nectin2P32507 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nectin2P32507 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nectin2P32507 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nectin2P32507 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nectin2P32507 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nectin2P32507 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nectin2P32507 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nectin2P32507 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nectin2P32507 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nectin2P32507 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Nectin2P32507 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nectin2P32507 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nectin2P32507 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nectin2P32507 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nectin2P32507 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nectin2P32507 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nectin2P32507 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nectin2P32507 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nectin2P32507 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nectin2P32507 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms