Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctnnd1P30999 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctnnd1P30999 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ctnnd1P30999 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctnnd1P30999 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctnnd1P30999 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctnnd1P30999 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctnnd1P30999 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ctnnd1P30999 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctnnd1P30999 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctnnd1P30999 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctnnd1P30999 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctnnd1P30999 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ctnnd1P30999 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctnnd1P30999 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ctnnd1P30999 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctnnd1P30999 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctnnd1P30999 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctnnd1P30999 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctnnd1P30999 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ctnnd1P30999 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctnnd1P30999 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctnnd1P30999 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctnnd1P30999 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctnnd1P30999 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctnnd1P30999 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctnnd1P30999 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctnnd1P30999 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctnnd1P30999 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctnnd1P30999 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctnnd1P30999 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ctnnd1P30999 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctnnd1P30999 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctnnd1P30999 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctnnd1P30999 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctnnd1P30999 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctnnd1P30999 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctnnd1P30999 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctnnd1P30999 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctnnd1P30999 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ctnnd1P30999 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctnnd1P30999 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ctnnd1P30999 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctnnd1P30999 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctnnd1P30999 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctnnd1P30999 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctnnd1P30999 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctnnd1P30999 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctnnd1P30999 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ctnnd1P30999 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctnnd1P30999 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctnnd1P30999 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctnnd1P30999 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctnnd1P30999 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctnnd1P30999 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ctnnd1P30999 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnnd1P30999 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnnd1P30999 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnnd1P30999 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnnd1P30999 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnnd1P30999 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnnd1P30999 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnnd1P30999 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ctnnd1P30999 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctnnd1P30999 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctnnd1P30999 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctnnd1P30999 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ctnnd1P30999 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctnnd1P30999 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctnnd1P30999 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ctnnd1P30999 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ctnnd1P30999 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ctnnd1P30999 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ctnnd1P30999 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ctnnd1P30999 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ctnnd1P30999 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ctnnd1P30999 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms