Protein–RNA interactions for Protein: P30658

Cbx2, Chromobox protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx2P30658 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cbx2P30658 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cbx2P30658 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cbx2P30658 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cbx2P30658 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cbx2P30658 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cbx2P30658 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cbx2P30658 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cbx2P30658 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cbx2P30658 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cbx2P30658 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cbx2P30658 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cbx2P30658 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Cbx2P30658 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cbx2P30658 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cbx2P30658 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cbx2P30658 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cbx2P30658 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cbx2P30658 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cbx2P30658 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cbx2P30658 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cbx2P30658 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cbx2P30658 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cbx2P30658 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cbx2P30658 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cbx2P30658 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cbx2P30658 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cbx2P30658 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cbx2P30658 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cbx2P30658 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cbx2P30658 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cbx2P30658 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cbx2P30658 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cbx2P30658 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cbx2P30658 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cbx2P30658 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cbx2P30658 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cbx2P30658 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cbx2P30658 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cbx2P30658 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cbx2P30658 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cbx2P30658 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cbx2P30658 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cbx2P30658 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cbx2P30658 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cbx2P30658 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cbx2P30658 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cbx2P30658 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Cbx2P30658 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cbx2P30658 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cbx2P30658 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cbx2P30658 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cbx2P30658 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cbx2P30658 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cbx2P30658 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cbx2P30658 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cbx2P30658 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cbx2P30658 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cbx2P30658 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cbx2P30658 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cbx2P30658 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cbx2P30658 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cbx2P30658 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Cbx2P30658 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cbx2P30658 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Cbx2P30658 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cbx2P30658 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cbx2P30658 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Cbx2P30658 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cbx2P30658 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cbx2P30658 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cbx2P30658 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cbx2P30658 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cbx2P30658 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cbx2P30658 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cbx2P30658 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cbx2P30658 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cbx2P30658 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cbx2P30658 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cbx2P30658 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cbx2P30658 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cbx2P30658 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cbx2P30658 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cbx2P30658 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cbx2P30658 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cbx2P30658 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cbx2P30658 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cbx2P30658 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cbx2P30658 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cbx2P30658 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cbx2P30658 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cbx2P30658 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cbx2P30658 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cbx2P30658 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cbx2P30658 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cbx2P30658 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cbx2P30658 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cbx2P30658 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cbx2P30658 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cbx2P30658 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms