Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VtnP29788 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VtnP29788 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VtnP29788 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VtnP29788 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VtnP29788 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
VtnP29788 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VtnP29788 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VtnP29788 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20■□□□□ 0.79
VtnP29788 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VtnP29788 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VtnP29788 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VtnP29788 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VtnP29788 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VtnP29788 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VtnP29788 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VtnP29788 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VtnP29788 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VtnP29788 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VtnP29788 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VtnP29788 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VtnP29788 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
VtnP29788 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VtnP29788 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
VtnP29788 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VtnP29788 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VtnP29788 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VtnP29788 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VtnP29788 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VtnP29788 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VtnP29788 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VtnP29788 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VtnP29788 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VtnP29788 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VtnP29788 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VtnP29788 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VtnP29788 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VtnP29788 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VtnP29788 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VtnP29788 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VtnP29788 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VtnP29788 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VtnP29788 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VtnP29788 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VtnP29788 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VtnP29788 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VtnP29788 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VtnP29788 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VtnP29788 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VtnP29788 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VtnP29788 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VtnP29788 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VtnP29788 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
VtnP29788 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VtnP29788 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VtnP29788 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VtnP29788 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VtnP29788 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VtnP29788 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
VtnP29788 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VtnP29788 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VtnP29788 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VtnP29788 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VtnP29788 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VtnP29788 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VtnP29788 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VtnP29788 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VtnP29788 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VtnP29788 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VtnP29788 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VtnP29788 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VtnP29788 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VtnP29788 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VtnP29788 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VtnP29788 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VtnP29788 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VtnP29788 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VtnP29788 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VtnP29788 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VtnP29788 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VtnP29788 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VtnP29788 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VtnP29788 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VtnP29788 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VtnP29788 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
VtnP29788 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VtnP29788 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VtnP29788 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VtnP29788 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VtnP29788 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VtnP29788 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VtnP29788 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VtnP29788 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VtnP29788 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VtnP29788 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VtnP29788 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VtnP29788 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
VtnP29788 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VtnP29788 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VtnP29788 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms