Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxd10P28359 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxd10P28359 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxd10P28359 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxd10P28359 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxd10P28359 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxd10P28359 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxd10P28359 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxd10P28359 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxd10P28359 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxd10P28359 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxd10P28359 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxd10P28359 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxd10P28359 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxd10P28359 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxd10P28359 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxd10P28359 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxd10P28359 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxd10P28359 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxd10P28359 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxd10P28359 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxd10P28359 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxd10P28359 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxd10P28359 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxd10P28359 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxd10P28359 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxd10P28359 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxd10P28359 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxd10P28359 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxd10P28359 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxd10P28359 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxd10P28359 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxd10P28359 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxd10P28359 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxd10P28359 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxd10P28359 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxd10P28359 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxd10P28359 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxd10P28359 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxd10P28359 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxd10P28359 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxd10P28359 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxd10P28359 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxd10P28359 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxd10P28359 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxd10P28359 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxd10P28359 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxd10P28359 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxd10P28359 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxd10P28359 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxd10P28359 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxd10P28359 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxd10P28359 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxd10P28359 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxd10P28359 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hoxd10P28359 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hoxd10P28359 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxd10P28359 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxd10P28359 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxd10P28359 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxd10P28359 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxd10P28359 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxd10P28359 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxd10P28359 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxd10P28359 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxd10P28359 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxd10P28359 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxd10P28359 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxd10P28359 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxd10P28359 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxd10P28359 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxd10P28359 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxd10P28359 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxd10P28359 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxd10P28359 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxd10P28359 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxd10P28359 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxd10P28359 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxd10P28359 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxd10P28359 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxd10P28359 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxd10P28359 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxd10P28359 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxd10P28359 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxd10P28359 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxd10P28359 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxd10P28359 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxd10P28359 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxd10P28359 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxd10P28359 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxd10P28359 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxd10P28359 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxd10P28359 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxd10P28359 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxd10P28359 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxd10P28359 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxd10P28359 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxd10P28359 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxd10P28359 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxd10P28359 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
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