Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tsta3P23591 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tsta3P23591 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tsta3P23591 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tsta3P23591 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tsta3P23591 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tsta3P23591 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tsta3P23591 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms