Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hoxd8P23463 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Hoxd8P23463 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxd8P23463 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxd8P23463 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxd8P23463 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxd8P23463 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hoxd8P23463 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxd8P23463 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxd8P23463 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxd8P23463 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxd8P23463 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hoxd8P23463 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxd8P23463 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxd8P23463 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxd8P23463 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxd8P23463 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxd8P23463 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hoxd8P23463 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd8P23463 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd8P23463 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd8P23463 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd8P23463 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd8P23463 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hoxd8P23463 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxd8P23463 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxd8P23463 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxd8P23463 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxd8P23463 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxd8P23463 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxd8P23463 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxd8P23463 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hoxd8P23463 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxd8P23463 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxd8P23463 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hoxd8P23463 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxd8P23463 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxd8P23463 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxd8P23463 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxd8P23463 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hoxd8P23463 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxd8P23463 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxd8P23463 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxd8P23463 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxd8P23463 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hoxd8P23463 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxd8P23463 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxd8P23463 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxd8P23463 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxd8P23463 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxd8P23463 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxd8P23463 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hoxd8P23463 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxd8P23463 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxd8P23463 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxd8P23463 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxd8P23463 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxd8P23463 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxd8P23463 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms