Protein–RNA interactions for Protein: P22005

Penk, Proenkephalin-A, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PenkP22005 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PenkP22005 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PenkP22005 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PenkP22005 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PenkP22005 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PenkP22005 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PenkP22005 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PenkP22005 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PenkP22005 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PenkP22005 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PenkP22005 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PenkP22005 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PenkP22005 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PenkP22005 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PenkP22005 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PenkP22005 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PenkP22005 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PenkP22005 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PenkP22005 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PenkP22005 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PenkP22005 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PenkP22005 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PenkP22005 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PenkP22005 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PenkP22005 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PenkP22005 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PenkP22005 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PenkP22005 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PenkP22005 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PenkP22005 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PenkP22005 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PenkP22005 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PenkP22005 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PenkP22005 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PenkP22005 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PenkP22005 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PenkP22005 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PenkP22005 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PenkP22005 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PenkP22005 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PenkP22005 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PenkP22005 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PenkP22005 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PenkP22005 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PenkP22005 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PenkP22005 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PenkP22005 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PenkP22005 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PenkP22005 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PenkP22005 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PenkP22005 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PenkP22005 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PenkP22005 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PenkP22005 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PenkP22005 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PenkP22005 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PenkP22005 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PenkP22005 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PenkP22005 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PenkP22005 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PenkP22005 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PenkP22005 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PenkP22005 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PenkP22005 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PenkP22005 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PenkP22005 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PenkP22005 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PenkP22005 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PenkP22005 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PenkP22005 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PenkP22005 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PenkP22005 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PenkP22005 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PenkP22005 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PenkP22005 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PenkP22005 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PenkP22005 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PenkP22005 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PenkP22005 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PenkP22005 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PenkP22005 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PenkP22005 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PenkP22005 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PenkP22005 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PenkP22005 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PenkP22005 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PenkP22005 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PenkP22005 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PenkP22005 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PenkP22005 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PenkP22005 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PenkP22005 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PenkP22005 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PenkP22005 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PenkP22005 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PenkP22005 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PenkP22005 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PenkP22005 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PenkP22005 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PenkP22005 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms